Eesti Mesinike Liidu juures töötavad järgmised töögrupid. Töögrupp teeb ettepanekuid konkreetse valdkonna arendamiseks ning selle tööst võib osa võtta iga huvitatud EML liige.
Käesoleval ajal töötavad EML juures järgmised töögrupid:
- Mesilashaiguste töögruppi juhib Aado Oherd, töös osalevad Antu Rohtla, Arvi Raie ja Hagbard Räis. Töögrupi esimene kohtumine Põllumajandusministeeriumi, VTA ja teiste mesindusorganisatsioonide esindajatega toimus 3-ndal märtsil 2015. Kohtumise memo saab lugeda siit.
- Taimekaitse töögruppi juhib Aleksander Kilk, töös osalevad Antu Rohtla, Maire Valtin ja Ingo Põder. Töögrupi esimene kohtumine Põllumajandusministeeriumi, Põllumajandusameti, Eesti Taimekasvatuse Instituudi, Eesti Põllumajandus-Kaubanduskoja ja teiste mesindusorganisatsioonide esindajatega toimus 4-ndal märtsil 2015. Arutelu kokkuvõtet saab lugeda siit.
- Mesilaspere toetuse töögruppi juhib Ülo Lippa, töös osalevad Erki Naumanis ning Jaan Pitsi. Kohtumine ministeeriumis leidis aset 11-ndal mail. Lühikokkuvõte asub siin ning enamikku ministeeriumile esitatud faile saab vaadata siit.
- Mahemesinduse töögruppi juhib Aivo Sildnik. Kohtumine ministeeriumis leidis aset 17 märtsil, memo paneme üles kohe kui laekub.
- Mesinduse arengukava töögruppi juhib Aleksander Kilk, liikmed Erki Naumanis, Anna Aunap, Antu Rohtla, Maire Valtin, Andres Tamla, Ain Seeder ja Marianne Rosenfeld.
- Mee kvaliteedi töögruppi juhib Anna Aunap, töös osalevad Astrid Oolberg, Marianne Rosenfeld ja Katrin Linask.
- Mesinduseprogrammi koostamise töögruppi juhib Aleksander Kilk, töös osalevad Ain Seeder ja Aivar Raudmets.
- Innovatsiooni klastri töögruppi juhib Marianne Rosenfeld, oodatud liituma mesinik-ettevõtjad, kuna see on peamiselt suunatud ettevõtlusele, huvilistel palun ühendust võtta töögrupi juhiga.